Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FNDC1Q4ZHG4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC1Q4ZHG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms