Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A3Q495N2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms