Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM50Q3ZCQ8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms