Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT71Q3SY84 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT71Q3SY84 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT71Q3SY84 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms