Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SP6Q3SY56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms