Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KRTAP13-3Q3SY46 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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KRTAP13-3Q3SY46 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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KRTAP13-3Q3SY46 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP13-3Q3SY46 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP13-3Q3SY46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP13-3Q3SY46 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP13-3Q3SY46 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP13-3Q3SY46 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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