Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX4Q33E94 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RFX4Q33E94 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFX4Q33E94 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFX4Q33E94 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFX4Q33E94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX4Q33E94 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms