Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TYSND1Q2T9J0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TYSND1Q2T9J0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TYSND1Q2T9J0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms