Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GEN1Q17RS7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GEN1Q17RS7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GEN1Q17RS7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
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