Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRNP35Q16560 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRNP35Q16560 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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