Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HLFQ16534 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HLFQ16534 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HLFQ16534 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HLFQ16534 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HLFQ16534 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HLFQ16534 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HLFQ16534 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HLFQ16534 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HLFQ16534 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HLFQ16534 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HLFQ16534 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HLFQ16534 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HLFQ16534 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HLFQ16534 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HLFQ16534 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HLFQ16534 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HLFQ16534 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HLFQ16534 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HLFQ16534 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HLFQ16534 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HLFQ16534 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HLFQ16534 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HLFQ16534 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HLFQ16534 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HLFQ16534 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HLFQ16534 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HLFQ16534 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HLFQ16534 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HLFQ16534 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HLFQ16534 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HLFQ16534 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HLFQ16534 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HLFQ16534 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HLFQ16534 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HLFQ16534 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HLFQ16534 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HLFQ16534 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HLFQ16534 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HLFQ16534 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HLFQ16534 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HLFQ16534 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HLFQ16534 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HLFQ16534 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLFQ16534 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLFQ16534 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLFQ16534 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLFQ16534 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLFQ16534 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HLFQ16534 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLFQ16534 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLFQ16534 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLFQ16534 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLFQ16534 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLFQ16534 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HLFQ16534 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HLFQ16534 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HLFQ16534 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLFQ16534 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLFQ16534 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLFQ16534 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLFQ16534 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLFQ16534 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLFQ16534 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLFQ16534 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLFQ16534 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLFQ16534 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLFQ16534 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLFQ16534 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLFQ16534 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLFQ16534 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLFQ16534 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HLFQ16534 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HLFQ16534 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HLFQ16534 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HLFQ16534 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HLFQ16534 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HLFQ16534 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HLFQ16534 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HLFQ16534 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HLFQ16534 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms