Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCEA2Q15560 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCEA2Q15560 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCEA2Q15560 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms