Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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SEC23BQ15437 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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SEC23BQ15437 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC23BQ15437 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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SEC23BQ15437 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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SEC23BQ15437 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC23BQ15437 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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