Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLR1Q15399 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR1Q15399 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms