Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PTPRKQ15262 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRKQ15262 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRKQ15262 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
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