Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZBTB46-204ENST00000460757 431 ntTSL 319.03■□□□□ 0.642e-9■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 CASC3-207ENST00000581849 580 ntTSL 220.88■□□□□ 0.934e-12■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 CASC3-208ENST00000583649 577 ntTSL 310.22□□□□□ -0.774e-12■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 CASC3-210ENST00000584997 543 ntTSL 39.62□□□□□ -0.874e-12■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 WDR73-204ENST00000558487 564 ntTSL 28.85□□□□□ -0.994e-12■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 WDR73-212ENST00000559877 551 ntTSL 37.78□□□□□ -1.164e-12■■■■■ 51.7
EFTUD2Q15029 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 51.6
EFTUD2Q15029 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.768e-13■■■■■ 51.6
EFTUD2Q15029 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.618e-13■■■■■ 51.6
EFTUD2Q15029 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.458e-13■■■■■ 51.6
EFTUD2Q15029 LUC7L2-203ENST00000435096 570 ntTSL 317.46■□□□□ 0.398e-13■■■■■ 51.6
EFTUD2Q15029 LUC7L2-209ENST00000608368 551 ntTSL 413.44□□□□□ -0.268e-13■■■■■ 51.6
EFTUD2Q15029 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.288e-13■■■■■ 51.6
EFTUD2Q15029 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.798e-13■■■■■ 51.6
EFTUD2Q15029 CHMP1A-204ENST00000547687 2007 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 51.5
EFTUD2Q15029 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.392e-11■■■■■ 51.3
EFTUD2Q15029 OSGEP-207ENST00000555223 773 ntTSL 513.77□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 51.3
EFTUD2Q15029 OSGEP-210ENST00000556124 1546 ntTSL 512.32□□□□□ -0.442e-11■■■■■ 51.3
EFTUD2Q15029 OSGEP-206ENST00000554915 586 ntTSL 211.07□□□□□ -0.642e-11■■■■■ 51.3
EFTUD2Q15029 OSGEP-209ENST00000555785 464 ntTSL 310.41□□□□□ -0.742e-11■■■■■ 51.3
EFTUD2Q15029 OSGEP-204ENST00000554249 987 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 51.3
EFTUD2Q15029 OSGEP-208ENST00000555656 3258 ntTSL 27.83□□□□□ -1.162e-11■■■■■ 51.3
EFTUD2Q15029 SET-211ENST00000485056 483 ntTSL 26.03□□□□□ -1.443e-27■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-NBL1-202ENST00000602384 999 ntTSL 516.87■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-NBL1-203ENST00000602450 590 ntTSL 216.77■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-NBL1-201ENST00000602293 820 ntTSL 314.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-209ENST00000498642 669 ntTSL 214.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-205ENST00000481464 657 ntTSL 313.61□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-203ENST00000467029 583 ntTSL 213□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-201ENST00000322753 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-210ENST00000617872 3678 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-207ENST00000486890 677 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 MINOS1-206ENST00000485362 438 ntTSL 24.87□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 51.2
EFTUD2Q15029 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.473e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 P3H3-202ENST00000536140 3226 ntTSL 214.3□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-203ENST00000420199 1002 ntTSL 314.14□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-212ENST00000589187 568 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 311.3□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 SNHG5-202ENST00000414002 430 ntTSL 29.09□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 51.1
EFTUD2Q15029 ARL8B-206ENST00000468010 452 ntTSL 52.46□□□□□ -2.023e-7■■■■■ 51
EFTUD2Q15029 PIEZO1-214ENST00000521877 686 ntTSL 216.35■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 51
EFTUD2Q15029 GAMT-204ENST00000640164 520 ntTSL 215.13■□□□□ 0.017e-10■■■■■ 51
EFTUD2Q15029 GAMT-203ENST00000591788 401 ntTSL 56.9□□□□□ -1.37e-10■■■■■ 51
EFTUD2Q15029 PELP1-205ENST00000570823 484 ntTSL 421.78■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 50.9
EFTUD2Q15029 CXXC1-217ENST00000592078 686 ntTSL 215.15■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 50.9
EFTUD2Q15029 MRPL55-223ENST00000459783 694 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.813e-17■■■■■ 50.9
EFTUD2Q15029 NLE1-204ENST00000588019 1107 ntTSL 516.17■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.118e-7■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.288e-7■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 08e-7■■■■■ 50.8
EFTUD2Q15029 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 50.8
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EFTUD2Q15029 RIPOR1-222ENST00000569474 754 ntTSL 317.14■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.18e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 RIPOR1-206ENST00000561534 714 ntTSL 514.45□□□□□ -0.18e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 RIPOR1-213ENST00000566522 592 ntTSL 514.13□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 RIPOR1-216ENST00000566815 929 ntTSL 513.77□□□□□ -0.218e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.448e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.58e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 OTX1-204ENST00000476383 564 ntTSL 419.87■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 CTSD-206ENST00000497544 783 ntTSL 219.65■□□□□ 0.744e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 OTX1-206ENST00000484066 1244 ntTSL 319.32■□□□□ 0.684e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 OTX1-203ENST00000405984 1694 ntTSL 217.45■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 OTX1-205ENST00000477348 624 ntTSL 317.11■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 CTSD-203ENST00000429746 690 ntTSL 316.78■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 CTSD-214ENST00000637937 1262 ntTSL 516■□□□□ 0.154e-8■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.393e-10■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.123e-10■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 SFXN2-212ENST00000602831 770 ntTSL 515.52■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.033e-10■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 SFXN2-204ENST00000602287 584 ntTSL 214.18□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 SFXN2-206ENST00000602544 606 ntTSL 414.09□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 SFXN2-205ENST00000602439 554 ntTSL 413.83□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 SFXN2-213ENST00000602868 642 ntTSL 212.24□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 SFXN2-210ENST00000602764 582 ntTSL 39.72□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 50.6
EFTUD2Q15029 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.135e-8■■■■■ 50.5
EFTUD2Q15029 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 50.5
EFTUD2Q15029 ANKLE2-202ENST00000439231 1725 ntTSL 311.29□□□□□ -0.65e-8■■■■■ 50.5
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-206ENST00000454184 547 ntTSL 415.4■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 50.5
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