Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCA4Q14CN2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA4Q14CN2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCA4Q14CN2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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