Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2H3Q13889 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H3Q13889 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H3Q13889 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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