Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP3AQ13472 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOP3AQ13472 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3AQ13472 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TOP3AQ13472 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TOP3AQ13472 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3AQ13472 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3AQ13472 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3AQ13472 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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