Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P3Q13401 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PMS2P3Q13401 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P3Q13401 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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