Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MINK1-210ENST00000574871 3150 ntTSL 212.76□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EXOC1-203ENST00000381295 3551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 PC-202ENST00000393958 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TSC1-207ENST00000493467 2219 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 DNAH14-213ENST00000453375 456 ntTSL 28□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.372e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 ABCD3-203ENST00000464165 3174 ntTSL 25.88□□□□□ -1.472e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.482e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.522e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 ABCD3-205ENST00000484213 4367 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.572e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 EXOC1-208ENST00000511971 3203 ntTSL 25.27□□□□□ -1.572e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 DNAH14-214ENST00000474127 773 ntTSL 34.87□□□□□ -1.632e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.942e-8■■■■■ 36.1
PABPC4Q13310 GAGE1-202ENST00000381709 3129 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.94e-10■■■■■ 36
PABPC4Q13310 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.734e-10■■■■■ 36
PABPC4Q13310 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.524e-10■■■■■ 36
PABPC4Q13310 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.14e-10■■■■■ 36
PABPC4Q13310 PCTP-203ENST00000417982 2234 ntTSL 222.47■■□□□ 1.197e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 PCTP-205ENST00000572536 647 ntTSL 39.46□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 PCTP-208ENST00000576221 609 ntTSL 59.32□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 PCTP-204ENST00000571489 3932 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.077e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 NAA10-214ENST00000482485 1075 ntTSL 218.73■□□□□ 0.591e-12■■■■■ 36
PABPC4Q13310 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 36
PABPC4Q13310 EPHB4-206ENST00000487222 5058 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 36
PABPC4Q13310 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 36
PABPC4Q13310 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 36
PABPC4Q13310 MYL4-204ENST00000570671 740 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-12■■■■■ 36
PABPC4Q13310 MYL4-203ENST00000536623 650 ntTSL 511.49□□□□□ -0.573e-12■■■■■ 36
PABPC4Q13310 MYL4-209ENST00000573747 640 ntTSL 510.1□□□□□ -0.793e-12■■■■■ 36
PABPC4Q13310 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 36
PABPC4Q13310 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.77e-7■■■■■ 35.9
PABPC4Q13310 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 35.9
PABPC4Q13310 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 35.8
PABPC4Q13310 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.161e-323■■■■■ 35.8
PABPC4Q13310 NARFL-211ENST00000565425 1918 ntTSL 522.31■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 35.8
PABPC4Q13310 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 35.8
PABPC4Q13310 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 35.8
PABPC4Q13310 NARFL-206ENST00000563051 2943 ntTSL 216.96■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 35.8
PABPC4Q13310 NARFL-214ENST00000566650 2818 ntTSL 216.37■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 35.8
PABPC4Q13310 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 35.8
PABPC4Q13310 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.653e-43■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-43■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.453e-16■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.961e-23■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.863e-16■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.791e-23■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-23■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 518.8■□□□□ 0.62e-14■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.112e-14■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-14■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 PIK3CB-206ENST00000469284 3164 ntTSL 55.61□□□□□ -1.512e-14■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.582e-14■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.14e-8■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 35.7
PABPC4Q13310 C19orf24-203ENST00000485191 1675 ntTSL 222.31■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 C19orf24-204ENST00000585716 558 ntTSL 515.32■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 KRT10-202ENST00000635956 583 ntTSL 226.3■■□□□ 1.84e-14■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.734e-14■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.993e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.953e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.613e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.073e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 520.69■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-212ENST00000494815 2187 ntTSL 220.53■□□□□ 0.883e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TSPAN4-211ENST00000468468 2777 ntTSL 217.28■□□□□ 0.363e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.066e-8■■■■■ 35.6
PABPC4Q13310 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.097e-7■■■■■ 35.5
PABPC4Q13310 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)21.23■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 35.5
PABPC4Q13310 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 220.74■□□□□ 0.917e-7■■■■■ 35.5
PABPC4Q13310 RUVBL2-205ENST00000595002 546 ntTSL 213.81□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 35.5
PABPC4Q13310 GATA2-204ENST00000489987 1433 ntTSL 224.22■■□□□ 1.474e-7■■■■■ 35.5
PABPC4Q13310 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 35.5
PABPC4Q13310 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.382e-9■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.792e-9■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.672e-9■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 MBOAT7-206ENST00000437868 2033 ntTSL 1 (best)21.11■□□□□ 0.972e-9■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 MBOAT7-212ENST00000494142 3039 ntTSL 1 (best)17.68■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 217.27■□□□□ 0.363e-31■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.653e-43■■■■■ 35.4
PABPC4Q13310 NECAB3-209ENST00000483813 1277 ntTSL 524.08■■□□□ 1.454e-8■■■■■ 35.4
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