Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MIR3177-201ENST00000578255 82 ntBASIC11.96□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 33.4
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TARDBPQ13148 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.761e-10■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 JAK2-204ENST00000636127 2615 ntTSL 514.53□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-226ENST00000487459 1681 ntTSL 512.32□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-223ENST00000467538 565 ntTSL 58.19□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-219ENST00000462544 550 ntTSL 46.9□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-214ENST00000434836 579 ntTSL 46.79□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-224ENST00000477742 780 ntTSL 46.55□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-218ENST00000449366 542 ntTSL 55.23□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 33.4
TARDBPQ13148 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 33.3
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TARDBPQ13148 PSMD14-202ENST00000437630 577 ntTSL 511.07□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 33.3
TARDBPQ13148 ALG13-227ENST00000622997 594 ntTSL 515.23■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 33.3
TARDBPQ13148 ALG13-210ENST00000471924 711 ntTSL 313.49□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 33.3
TARDBPQ13148 ALG13-216ENST00000486353 916 ntTSL 57.99□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 33.3
TARDBPQ13148 ALG13-218ENST00000487141 745 ntTSL 56.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 33.3
TARDBPQ13148 ALG13-235ENST00000624881 876 ntTSL 54.68□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 33.3
TARDBPQ13148 THOC2-206ENST00000433883 876 ntTSL 55.23□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.012e-9■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.082e-9■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 422.93■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.021e-323■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.253e-8■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.313e-8■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 PHF21A-211ENST00000529734 557 ntTSL 413.46□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 PHF21A-218ENST00000532883 1051 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 PHF21A-203ENST00000524497 555 ntTSL 54.06□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 DCUN1D4-213ENST00000507741 1584 ntTSL 221.45■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 DCUN1D4-216ENST00000509376 2293 ntTSL 219.49■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 33.2
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TARDBPQ13148 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 DCUN1D4-204ENST00000477560 4840 ntTSL 24.31□□□□□ -1.721e-7■■■■■ 33.2
TARDBPQ13148 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 33.1
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TARDBPQ13148 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 33.1
TARDBPQ13148 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 33.1
TARDBPQ13148 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 514.1□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 33.1
TARDBPQ13148 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 211.46□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 33.1
TARDBPQ13148 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.676e-9■■■■■ 33.1
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TARDBPQ13148 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.376e-9■■■■■ 33.1
TARDBPQ13148 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.396e-9■■■■■ 33.1
TARDBPQ13148 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.856e-9■■■■■ 33.1
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TARDBPQ13148 HDAC6-223ENST00000480525 412 ntTSL 34.92□□□□□ -1.625e-7■■■■■ 33.1
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TARDBPQ13148 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.325e-22■■■■■ 33
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TARDBPQ13148 CMC1-205ENST00000466830 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.655e-9■■■■■ 33
TARDBPQ13148 CMC1-209ENST00000477739 3749 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.915e-9■■■■■ 33
TARDBPQ13148 CMC1-202ENST00000396610 593 ntTSL 25.48□□□□□ -1.535e-9■■■■■ 33
TARDBPQ13148 CMC1-203ENST00000418849 484 ntTSL 34.24□□□□□ -1.735e-9■■■■■ 33
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TARDBPQ13148 ZFPL1-205ENST00000526334 692 ntTSL 317.7■□□□□ 0.429e-8■■■■■ 33
TARDBPQ13148 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.259e-8■■■■■ 33
TARDBPQ13148 ZFPL1-202ENST00000453524 718 ntTSL 516.38■□□□□ 0.219e-8■■■■■ 33
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TARDBPQ13148 PTPRF-205ENST00000414879 4836 ntTSL 211.54□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 33
TARDBPQ13148 PTPRF-204ENST00000412568 4154 ntTSL 510.77□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 33
TARDBPQ13148 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 223.53■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 33
TARDBPQ13148 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 56.37□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 33
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