Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAA1Q13131 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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PRKAA1Q13131 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAA1Q13131 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
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PRKAA1Q13131 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PRKAA1Q13131 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PRKAA1Q13131 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PRKAA1Q13131 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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PRKAA1Q13131 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAA1Q13131 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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