Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECH1Q13011 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECH1Q13011 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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