Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD4Q12950 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD4Q12950 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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