Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXF2Q12947 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXF2Q12947 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms