Protein–RNA interactions for Protein: Q12870

TCF15, Transcription factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF15Q12870 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF15Q12870 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF15Q12870 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF15Q12870 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms