Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF4Q08170 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms