Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TFF3Q07654 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms