Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TNFRSF9Q07011 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF9Q07011 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms