Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK18Q07002 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK18Q07002 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms