Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMX2Q04743 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX2Q04743 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMX2Q04743 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms