Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTN2Q02246 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTN2Q02246 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNTN2Q02246 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms