Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COX6A2Q02221 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX6A2Q02221 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COX6A2Q02221 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX6A2Q02221 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX6A2Q02221 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms