Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHDQ02161 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHDQ02161 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHDQ02161 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHDQ02161 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHDQ02161 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHDQ02161 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHDQ02161 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHDQ02161 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHDQ02161 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHDQ02161 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHDQ02161 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHDQ02161 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHDQ02161 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHDQ02161 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHDQ02161 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHDQ02161 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHDQ02161 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHDQ02161 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHDQ02161 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHDQ02161 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHDQ02161 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHDQ02161 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHDQ02161 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHDQ02161 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHDQ02161 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHDQ02161 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHDQ02161 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHDQ02161 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHDQ02161 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHDQ02161 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHDQ02161 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHDQ02161 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHDQ02161 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHDQ02161 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHDQ02161 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHDQ02161 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHDQ02161 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms