Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A3Q01959 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC6A3Q01959 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms