Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MC1RQ01726 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MC1RQ01726 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MC1RQ01726 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms