Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK17Q00537 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK17Q00537 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms