Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL1Q00532 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms