Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNAQ00169 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms