Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKOR1P84550 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKOR1P84550 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms