Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
JAG1P78504 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
JAG1P78504 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
JAG1P78504 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
JAG1P78504 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
JAG1P78504 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
JAG1P78504 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
JAG1P78504 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
JAG1P78504 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
JAG1P78504 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
JAG1P78504 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
JAG1P78504 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
JAG1P78504 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
JAG1P78504 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
JAG1P78504 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
JAG1P78504 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
JAG1P78504 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
JAG1P78504 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
JAG1P78504 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
JAG1P78504 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
JAG1P78504 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
JAG1P78504 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
JAG1P78504 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
JAG1P78504 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
JAG1P78504 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
JAG1P78504 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
JAG1P78504 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
JAG1P78504 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
JAG1P78504 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
JAG1P78504 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
JAG1P78504 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
JAG1P78504 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
JAG1P78504 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
JAG1P78504 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
JAG1P78504 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
JAG1P78504 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
JAG1P78504 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
JAG1P78504 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
JAG1P78504 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
JAG1P78504 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
JAG1P78504 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
JAG1P78504 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
JAG1P78504 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
JAG1P78504 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
JAG1P78504 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
JAG1P78504 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
JAG1P78504 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
JAG1P78504 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
JAG1P78504 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
JAG1P78504 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
JAG1P78504 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
JAG1P78504 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
JAG1P78504 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
JAG1P78504 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
JAG1P78504 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
JAG1P78504 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
JAG1P78504 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
JAG1P78504 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
JAG1P78504 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
JAG1P78504 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
JAG1P78504 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
JAG1P78504 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
JAG1P78504 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
JAG1P78504 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
JAG1P78504 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
JAG1P78504 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
JAG1P78504 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
JAG1P78504 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
JAG1P78504 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
JAG1P78504 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
JAG1P78504 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
JAG1P78504 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
JAG1P78504 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
JAG1P78504 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
JAG1P78504 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
JAG1P78504 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
JAG1P78504 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
JAG1P78504 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
JAG1P78504 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
JAG1P78504 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
JAG1P78504 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
JAG1P78504 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
JAG1P78504 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
JAG1P78504 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
JAG1P78504 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
JAG1P78504 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
JAG1P78504 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
JAG1P78504 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
JAG1P78504 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
JAG1P78504 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
JAG1P78504 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
JAG1P78504 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
JAG1P78504 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
JAG1P78504 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
JAG1P78504 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
JAG1P78504 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
JAG1P78504 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
JAG1P78504 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
JAG1P78504 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
JAG1P78504 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms