Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT2P78371 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT2P78371 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT2P78371 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT2P78371 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCT2P78371 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT2P78371 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT2P78371 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT2P78371 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT2P78371 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCT2P78371 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCT2P78371 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCT2P78371 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT2P78371 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT2P78371 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT2P78371 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT2P78371 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT2P78371 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT2P78371 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT2P78371 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCT2P78371 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT2P78371 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT2P78371 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCT2P78371 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT2P78371 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT2P78371 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT2P78371 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT2P78371 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT2P78371 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT2P78371 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCT2P78371 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT2P78371 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT2P78371 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT2P78371 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT2P78371 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT2P78371 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT2P78371 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCT2P78371 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCT2P78371 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCT2P78371 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCT2P78371 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCT2P78371 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT2P78371 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT2P78371 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT2P78371 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCT2P78371 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCT2P78371 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT2P78371 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT2P78371 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT2P78371 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCT2P78371 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCT2P78371 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCT2P78371 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCT2P78371 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCT2P78371 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms