Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTG2P63267 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTG2P63267 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms