Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP1P63208 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP1P63208 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKP1P63208 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKP1P63208 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP1P63208 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP1P63208 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP1P63208 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP1P63208 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP1P63208 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP1P63208 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP1P63208 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKP1P63208 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SKP1P63208 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP1P63208 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP1P63208 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP1P63208 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP1P63208 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP1P63208 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP1P63208 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKP1P63208 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP1P63208 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP1P63208 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP1P63208 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP1P63208 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP1P63208 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP1P63208 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP1P63208 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKP1P63208 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP1P63208 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP1P63208 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP1P63208 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP1P63208 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP1P63208 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP1P63208 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKP1P63208 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKP1P63208 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKP1P63208 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP1P63208 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP1P63208 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP1P63208 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP1P63208 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP1P63208 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKP1P63208 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SKP1P63208 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKP1P63208 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKP1P63208 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKP1P63208 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKP1P63208 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKP1P63208 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKP1P63208 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKP1P63208 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKP1P63208 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKP1P63208 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKP1P63208 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKP1P63208 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKP1P63208 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKP1P63208 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKP1P63208 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms