Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P62891 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P62891 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P62891 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P62891 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P62891 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPL39P62891 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL39P62891 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPL39P62891 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL39P62891 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P62891 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P62891 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P62891 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P62891 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL39P62891 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms