Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL7AP62424 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPL7AP62424 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL7AP62424 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms