Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX16P57768 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX16P57768 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX16P57768 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX16P57768 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX16P57768 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX16P57768 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX16P57768 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX16P57768 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX16P57768 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX16P57768 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX16P57768 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX16P57768 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX16P57768 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX16P57768 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX16P57768 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX16P57768 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX16P57768 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX16P57768 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX16P57768 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX16P57768 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX16P57768 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX16P57768 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX16P57768 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX16P57768 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX16P57768 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX16P57768 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX16P57768 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX16P57768 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX16P57768 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX16P57768 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX16P57768 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX16P57768 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX16P57768 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX16P57768 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX16P57768 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX16P57768 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX16P57768 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX16P57768 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX16P57768 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX16P57768 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX16P57768 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX16P57768 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX16P57768 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX16P57768 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX16P57768 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX16P57768 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX16P57768 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX16P57768 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX16P57768 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX16P57768 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX16P57768 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX16P57768 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX16P57768 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX16P57768 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX16P57768 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX16P57768 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX16P57768 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX16P57768 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX16P57768 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX16P57768 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms