Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3AP57075 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBASH3AP57075 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3AP57075 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms