Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP1P56715 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP1P56715 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP1P56715 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP1P56715 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP1P56715 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP1P56715 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP1P56715 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP1P56715 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RP1P56715 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RP1P56715 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP1P56715 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP1P56715 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP1P56715 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP1P56715 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP1P56715 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RP1P56715 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP1P56715 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP1P56715 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP1P56715 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP1P56715 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP1P56715 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP1P56715 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP1P56715 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP1P56715 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP1P56715 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP1P56715 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP1P56715 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP1P56715 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP1P56715 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP1P56715 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP1P56715 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP1P56715 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP1P56715 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP1P56715 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP1P56715 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP1P56715 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP1P56715 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP1P56715 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP1P56715 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP1P56715 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP1P56715 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP1P56715 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP1P56715 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP1P56715 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP1P56715 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP1P56715 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RP1P56715 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RP1P56715 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RP1P56715 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RP1P56715 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP1P56715 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP1P56715 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP1P56715 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP1P56715 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP1P56715 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP1P56715 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.9 ms